美国国防部长马蒂斯2017年初访日时表示“钓鱼岛适用‘日美安保条约’”，而面对钓鱼岛被蚕食鲸吞，蔡英文和“驻日代表”谢长廷均未对此作出表态，引发岛内批评两人是“儿皇帝”“孙代表”。

除了上述职务，他还有诸多学术兼职，包括教育部高校历史学科教学指导委员会委员、中国社会史学会常务理事、中国经济史学会理事、太平天国史研究会常务理事、日本广岛历史学会海外评议员等。

《联网呼叫、智能康复……智慧养老“一键”直达》国民党文传会副主委唐德明痛批，渔民权益被牺牲，但翻遍所有报纸，不论是蔡英文办公室、台当局行政主管部门或者所谓的“驻日代表”谢长廷，都没对任何渔民表示歉意的相关说法，好像渔民权益只是无足轻重的一件小事而已。唐德明表示，民进党当局上台后，一再强调“与日本关系友好”，但用人民权益换来的，都只是看得到吃不到的所谓“政治好处”，“对所有台湾民众来说，蔡当局对日本的谄媚，都像是热脸贴冷屁股而已。”