国民党文传会副主委唐德明痛批，渔民权益被牺牲，但翻遍所有报纸，不论是蔡英文办公室、台当局行政主管部门或者所谓的“驻日代表”谢长廷，都没对任何渔民表示歉意的相关说法，好像渔民权益只是无足轻重的一件小事而已。唐德明表示，民进党当局上台后，一再强调“与日本关系友好”，但用人民权益换来的，都只是看得到吃不到的所谓“政治好处”，“对所有台湾民众来说，蔡当局对日本的谄媚，都像是热脸贴冷屁股而已。”

台当局指责陆方没有就启用M503北上航线与台方事先商讨。必须指出，这完全是台当局拒绝承认“九二共识”、导致两岸正式沟通渠道瘫痪所致。大陆空管部门在航线启用之前知会了台湾相关部门，在两岸无高级别磋商管道的情况下做到了仁至义尽。台方如果想要更多磋商，他们应该去找蔡英文，请她改变拒认一中的态度，推动恢复两岸直接交流管道。

《人社部：坚决防范、及时化解各类欠薪矛盾纠纷》2016年3月，中央军委国防动员部部长盛斌在两会期间表示，按照以往相关法律规定，省军区系统是同级党委的军事部、地方政府的兵役机构、当地驻军的协调机关。此次军改中，省军区转隶划归军委国防动员部领导管理。